Finansavimas

Pienarūgštės bakterijos (LAB – angl., lactic acid bacteria) – tai nuo seno didelę technologinę reikšmę maisto pramonėje turintys neinvaziniai ir nepatogeniški mikroorganizmai. Vienas iš žinomiausių LAB pavyzdžių – bakterijos Lactobacillus casei, kurios yra plačiai naudojamos kaip komerciniai probiotikai. Šios bakterijos aptinkamos žmogaus virškinamajame trakte, kur kartu su kitais mikroorganizmais sudaro natūralią žmogaus žarnyno mikroflorą. Čia L. casei nuolat susiduria su stresinėmis sąlygomis, pavyzdžiui, pirminiu žmogaus imuninio atsako veiksniu lizocimu, įvairias patogenais ar antibiotikais. Siekiant išsiaiškinti, kaip šios bakterijos išgyvena ir prisitaiko prie kintančių sąlygų, svarbu suprasti, kaip formuojasi ir streso metu pakinta bakterijos ląstelės sienelė, kuri sudaro barjerą, skiriantį bakterijos ląstelę nuo aplinkos. Nemažai tyrimų atlikta, siekiant išaiškinti baltymų vaidmenį L. casei ląstelės sienelės formavimesi, tačiau bakterinių mažųjų nekoduojančių RNR (sRNR – angl., small RNA) vaidmuo šiame procese beveik netyrinėtas. sRNR – tai 40-500 nt ilgio RNR molekulės, kurios yra svarbios potranskripcinės genų raiškos reguliacijai bakterijose. Nors dauguma sRNR nėra būtinos normaliai ląstelės veiklai palaikyti, jos tampa itin svarbios bakterijoms atsakant į aplinkos sukeliamą stresą. Šio projekto metu bus siekiama identifikuoti probiotinių gram-teigiamų bakterijų Lactobacillus casei BL23 mažąsias nekoduojančias RNR, reguliuojančias atsaką į antibiotikus, veikiančius bakterijos ląstelės sienelę. Tikslui įgyvendinti bioinformatiniais metodais nuspėtos sRNR, galimai susijusios su ląstelės sienelės formavimosi procesais, bus klonuojamos į L. casei bakterijose pasilaikantį vektorių. Sukėlus šių sRNR perraišką, bus stebimi bakterijų augimo pokyčiai jas paveikus antibiotikais. Projekto metu sukauptos žinios apie L. casei atsparumą antibiotikams bus naudingos platesniam L. casei panaudojimui bei geresniam sRNR atsparumo reguliacijos mechanizmų LAB supratimui.