Finansavimas

Šios mokslinės praktikos tikslas – studentės Rimvydės Čepaitės mokslinės kvalifikacijos kėlimas ir tobulinimas, įsisavinant naujus bioinformatikos ir eksperimentinius molekulinius metodus. Įgyvendinant šį tikslą, mokslinėje Prokariotų molekulinės mikrobiologijos ir taksonomijos laboratorijoje bus atlikti bakteriocinų genų raiškos tyrimai. Šiems tyrimams pasirinkti du Paenibacillus sp. kamienai, išskirti iš Kruberio-Voronja urvo. Šių kamienų genomuose identifikuota po kelis bakteriocinų genus, tame tarpe - ir menkai ištirtų saktipeptidų ir laso peptidų genai. Mokslinės praktikos metu bus sukonstruoti pradmenys, skirti šių genų pagausinimui bei raiškos tyrimui. Siekiant įvertinti maisto medžiagų prieinamumo bei kultūros augimo fazės įtaką bakteriocinų genų raiškai, bus sudarytos abiejų kamienų augimo kreivės. Suminės RNR skyrimas raiškos tyrimams bus atliktas atsižvelgiant į šias kreives. Kokybinis raiškos tyrimas bus atliktas naudojant atvirkštinės transkripcijos PGR. Atlikti tyrimai leis įvertinti bakteriocinų genų raiškos tendencijas dviejuose Paenibacillus sp. kamienuose. Svarbu pažymėti, kad bakteriocinų genų paieška urvų mikroorganizmuose niekada iki šiol nebuvo atlikta, taip pat nieko nėra žinoma apie šių genų raišką urvų mikroorganizmuose. Vykdydama šiuos darbus, studentė įgis naujų mokslinio darbo planavimo, tyrimų strategijos parinkimo, eksperimentinio darbo ir rezultatų analizės įgūdžių bei praplės savo gebėjimų ir kompetencijų ribas.