Finansavimas

Šiuo studentų mokslinės praktikos projektu siekiama gerinti bakalauro studento mokslinę kvalifikaciją vykdant tyrimus su bakterijų A. flos-aquae I-D tipo CRISPR-Cas sistemos efektoriniu kompleksu. CRISPR-Cas sistemos – gynybinės bakterijų ir archėjų sistemos, naudojančios crRNR vedlį savo karpomam taikiniui aptikti. Šių sistemų veikimo mechanizmai ir įvairovė itin plati. Funkcionalius efektorinius CRISPR-Cas kompleksus sudaro vienas (2 klasė) ar daugiau baltymų (1 klasė). Pirmosios klasės Cas baltymų kompleksai su crRNR gali veikti prieš dgDNR (I tipas) arba prieš vgRNR (III tipas). Remiantis bioinformatiniais tyrimais, I-D tipo CRISPR-Cas sistemos laikomos evoliuciniais tarpininkais tarp I ir III tipo sistemų. Eksperimentiškai I-D tipo CRISPR sistemų aktyvumas dar neaptiktas nei prieš DNR, nei prieš RNR. Tyrimo metu bus dirbama su I-D tipo sistema iš Kuršių marių melsvabakterių A. flos aquae siekiant išgauti funkcionalų I-D tipo sistemos efektorinį kompleksą ir charakterizuoti jo sudėtį. Projektas bakalauro studentą susipažindins su plačiai taikoma CRISPR-Cas sistemų technologija, padės įgyti praktinių įgūdžių vykdant biocheminius tyrimus ir juos pristatant.