Finansavimas

Šiuo studentų mokslinės praktikos projektu siekiama gerinti jauno tyrėjo mokslinę kvalifikaciją, eksperimentų planavimo ir pristatymo įgūdžius vykdant tyrimus su bakterijų A. flos-aquae I-D tipo CRISPR-Cas sistema. CRISPR-Cas sistemos – bakterijų ir archėjų sistemos, naudojančios crRNR vedlį savo specifiniam taikiniui aptikti. Šių sistemų veikimo mechanizmai ir įvairovė itin plati. Funkcionalius CRISPR-Cas kompleksus gali sudaryti vienas (2 klasė) ar daugiau baltymų (1 klasė). Pirmosios klasės Cas baltymų kompleksai su crRNR gali veikti prieš dgDNR (I tipas) arba prieš vgRNR (III tipas). III tipo kompleksams dar būdingi papildomi fermentiniai aktyvumai – nuo transkripcijos priklausomas DNR karpymas, vgDNR karpymas ar ciklinių signalinių molekulių sintezė. Remiantis daugiausiai bioinformatiniais genų palyginių tyrimais, I-D tipo CRISPR-Cas sistemos laikomos evoliuciniais tarpininkais tarp I ir III tipo sistemų. Eksperimentiškai I-D tipo CRISPR sistemų aktyvumas dar neaptiktas nei prieš DNR, nei prieš RNR. Tyrimo metu bus dirbama su I-D tipo sistema iš Kuršių marių melsvabakterių A. flos aquae siekiant nustatyti šios sistemos veikimą heterologinėje E. coli sistemoje in vivo ir gauti duomenų apie galimą I-D tipo CRISPR-Cas sistemų veikimo molekulinį mechanizmą. Projektas jauną tyrėją susipažindins su plačiai taikoma CRISPR-Cas sistemų technologija, padės įgyti praktinių įgūdžių vykdant mokslinius eksperimentus ir juos pristatant.