Finansavimas

Nikotinamido adenino dinukleotidas (NAD) yra būtinas ląstelių kofermentas, kurio pagrindinė funkcija – metabolinių procesų užtikrinimas dalyvaujant oksidacijos-redukcijos reakcijose. Vienas iš šio kofermento koncentraciją ląstelėje reguliuojančių veiksnių – tai NAD hidrolizuojantys fermentai, pavyzdžiui, Nudix superšeimos hidrolazės. Dėl šių fermentų įtakos biosintezės reakcijoms kritiškai svarbiam NAD+/NADH santykiui ir vaidmens bakterijų patogenezėje, Nudix hidrolazių tyrimai tampa vis aktualesni pramoniniu ir medicininiu aspektu. Nors Nudix hidrolazės yra identifikuotos visuose organizmų domenuose: bakterijose, archėjose, eukariotuose, tačiau apie jas vis dar trūksta informacijos tokioje svarbioje organizmų grupėje kaip Lactobacillales eilės pienarūgštės bakterijos (LAB), kurios yra ypač reikšmingos dėl savo probiotinių savybių, panaudojimo fermentacijos procesuose. Be to, šiai bakterijų grupei priklauso pneumoniją, meningitą bei kitas ligas sukeliantys patogeniniai mikroorganizmai.Šio projekto tikslas yra užpildyti esamą informacijos spragą – identifikuoti ir charakterizuoti Nudix domeną turinčius baltymus Lactobacillales eilės bakterijose. Tikslui pasiekti pirmiausia bus atlikta bioinformatinė Nudix domeną turinčių baltymų paieška tiriamoje bakterijų grupėje. Siekiant nuspėti papildomas identifikuotų baltymų funkcijas, bus charakterizuojami ir kiti, greta esantys domenai. Bioinformatinės analizės rezultatai bus apibendrinti suklasifikavus identifikuotus baltymus. Bent viena iš naujai atrastų potencialių Nudix hidrolazių bus klonuota, išgryninta ir bus įvertintas jos fermentinis aktyvumas. Projekto metu gauti rezultatai padės pagrindą tolimesniems Nudix hidrolazių tyrimams Lactobacillales eilės bakterijose siekiant išsiaiškinti šių fermentų funkcijas ir biologinę reikšmę, nustatyti potencialias jų praktinio pritaikymo galimybes. Be to, šiuo projektu bus prisidėta prie plataus profilio specialistės parengimo, kurios žinios ir patirtis bus naudingi ir ateityje.