Finansavimas

Padidinto jautrumo testai leidžiantys tiksliai įvertinti viruso paplitimą populiacijoje yra viena iš esminių priemonių tiek identifikuojant naujus SARS-CoV-2 židinius, tiek valdant pandemijos paplitimą. Priklausomai nuo testavimo rezultatų yra priimami svarbūs socioekonominiai sprendimai nulemiantys žmonių gyvenimo apribojimus. Žemo jautrumo ir prasto atsikartojamumo analitiniai metodai, yra net tik nepageidaujami, bet ir gali turėti žalingų padarinių. Todėl svarbu taikyti kuo jautresnius testus ir analizes. Nuo 2020 m. pasaulyje buvo atlikta virš 500 milijonų SARS-CoV-2 testų, o jų poreikis tebeauga atsirandant naujiems viruso variantams. Deja plačiai naudojamo atvirkštinės transkripcijos PGR (AT-PGR) testas, turi detekcijos ribą ~100-1000 viruso genomų vienoje reakcijoje, o tai savo ruožtu nulemia plačiai varijuojantį klinikinį jautrumą (32-96%), kuris priklauso nuo mėginio paėmimo laiko ir audinio, viruso titro, inhibitorių ir kitų faktorių. Atsižvelgiant į šiuos trūkumus, šio projekto metu bus vystomas padidinto jautrumo skaitmeninis AT-PGR metodas skirtas absoliučiam tiriamos genetinės informacijos nustatymui mėginyje. Projekto idėja remiasi lašelių mikroskysčių technologija ir jos teikiamais privalumais: absoliutus analitės kvantifikavimas, didesnis atsparumas analitines reakcijas slopinantiems veiksniams, tokiems kaip foninės DNR perteklius ar polimerazės slopikliai. Sukurtas padidinto jautrumo metodas išplės dabartines testavimo galimybes. Pavyzdžiui, galima bus tirti didesnes grupes kaupinių metodu arba aptikti itin mažus kiekius virusinės DNR aplinkos mėginiuose. Parinkus skirtingus DNR pradmenis tuo pat metu bus galima detektuoti tiek laukinio, tiek mutantinio tipo variantus.