Finansavimas

Gamtinė atranka yra pagrindinis evoliucijos veiksnys galintis keisti genomo struktūrą. Dėl šios priežasties aplinkos ir mikroevoliuciniai veiksniai bei jų intensyvumas lemia populiacijos gebėjimą prisitaikyti prie kintančių aplinkos sąlygų. Projekto tikslas yra nustatyti protekcinius ir patogeninius žmogaus genomo alelius panaudojant naujos kartos sekoskaitos ir genomo redagavimo technologijas. Populiacijos adaptacijos procesai bus nustatomi analizuojant tris kohortas – bendros Lietuvos populiacijos, Černobylio avarijos likvidatorių, Lietuvos naujagimių ir jų tėvų. Paveldimų ir de novo protekcinių ir patogeninių genomo variantų nustatymas bus atliktas analizuojant atrinktų tiriamųjų plataus masto genotipavimo ir viso genomo sekoskaitos duomenis. Taikant plataus masto VNP genotipavimo duomenis bus išsamiai charakterizuota Lietuvos populiacijos genetinė struktūra ir kilmė bei bus atlikta teigiamos gamtinės atrankos analizė ir jos poveikis lietuvių genomui. Nežinomi protekciniai genomo variantai bus identifikuoti ir charakterizuoti lyginant Černobylio avarijos likvidatorių, naujagimių ir bendros Lietuvos populiacijos duomenis. Nustatytų atrinktų variantų funkcinės reikšmės įvertinimui planuojama taikyti funkcinės genomikos tyrimo technologijas, apimančias molekulinius genetinius tyrimo metodus ir in vitro modelines sistemas. CRISPR-Cas9 sistema bus taikoma varianto funkcinės reikšmės nustatymui žmogaus ląstelių kultūrose. Atlikus genotipo-fenotipo ryšio analizę bus įvertintos fenotipo savybės ir patvirtintų variantų molekulinės charakteristikos. Gauti rezultatai bus visapusiškai naudingi tolimesniems fundamentiniams ir evoliucinės genomikos tyrimams bei prevencinei ir asmeninei medicinai. Tokie tyrimai yra reikalingi geresniam supratimui apie egzistuojančius ryšius tarp gamtinės atrankos ir ligų, taip pat evoliucinius mechanizmus, dėl kurių individų ir populiacijos lygmenyje polinkis sirgti tam tikromis ligomis yra skirtingas.